沿途遇槛阶，需以檀木戗桥覆素绸，确保梓宫“不沾尘，不触地”。
至乾清宫正殿，梓宫暂置于蟠龙金漆宝床上，床周设七盏长明铜灯，灯油掺入天启帝生前御用龙涎香，青烟缭绕如龙形。
正殿内，香案高供三牲五谷，青铜鼎中焚烧着福建进贡的沉水香。
朱慈炅率众再行三跪九叩大礼。
“蜀琴且勿弹，齐竽且莫吹。四筵并寂听，听我《薤露》诗。昨日七尺躯，今日为死尸。亲戚空满堂，魂气安所之。……”太常寺卿钱谦益在一侧领唱着刘伯温传下来《薤露歌》。
太子朱慈炅领初献，独献玄酒（清水）于灵前铜盆，喻“清平之始”；皇后张氏率后妃献素帛九匹，匹匹织有“日月星辰”十二章纹。
信王朱由检领亚献，代表宗室献赤金哀册，册文由翰林院连夜撰写，首句“维皇七载，龙驭上宾”以朱砂填色；诸王公主献青玉哀圭，圭身刻“孝悌忠信”四字。
内阁黄立极与英国公张维贤领终献。黄立极献《山河社稷图》，图卷展开时，英国公以辽东战报焚于灵前，灰烬落于图上宁远城位置，暗喻“魂镇边关”。
礼成刹那，似有风穿殿而过，长明灯焰骤升三尺。
钦天监监正高呼，“紫微星动，新主承辉”。
黄立极张维贤领文武百官，再次跪倒,“请皇太子于先帝灵前继皇帝位。”
张皇后从王体乾手中接过传国玉玺，递给朱慈炅。
朱慈炅盯着”大明皇帝朱由校之灵位”，沉默良久，终于接过。
文武百官山呼万岁，声浪穿透重重宫墙。
百官缓缓退下，大明皇帝朱慈炅还要率后妃公主诸王子等为天启守灵。
但从此时开始，虽然朱慈炅还没有举行登基大典，他已经不再是皇太子，而是皇帝了，可以自称朕了。