把泪地哭着恳求民兵不要抓他，说他愿意再次“降为明官”。
不过抓捕他的民兵根本不听他的鬼话，把他和方亨一起投进了监狱。
把方亨、莫士英关进监狱后，指挥部里的人又对陈明遇说，既已动手，索性把常州府派来江阴监督执行“剃发令”的住在都察院的4个清兵也杀了。
陈明遇同意，并速派数十人，手持大刀、弓箭，包围了都察院。
见4个清兵闭门不出来缴械投降，失去耐心的十几个人，砸开门冲进了都察院，被躲在暗处的清兵发射的矢箭射中，伤了五六个人。
见状，其余的民兵迅速退到门外。但有几个大胆的民兵不怕死，提着大片刀冲进都察院，追杀清兵，吓得4个清兵四处乱逃。
其中一个亲兵坠到茅房的粪坑里，一个躲匿在茅房内，一个钻进夹墙里，一个爬到屋顶上，但都被一一抓获。
没经陈明遇授权，民兵们就把4个清兵押到都察院大堂私自审问。4个清兵说满语，吃生的东西，还当庭小便，席地而卧，很是野蛮愚昧的样子。
审问的民兵听不懂满语，不知4个清兵叽哩咕啰说些什么，以为他们真的是满人。
可当有人到他们住的屋里一看，只见床席、蚊帐，跟江阴人用的一模一样，于是怀疑起了他们。
再经过拷打盘问，4个清兵终于承认他们不是满人，是苏州人。
他们匍匐在地，哭求饶命，但民兵们未经请示陈明遇，当即把4个清兵磔成肉饼。
死前，4个清兵哭道，是莫士英主簿要我们来江阴的。他害死了我们，死得冤啊！
如果顾横此刻知道，一定认为“江阴事变”没有章法，谁都有权杀人，一片动乱。
“江阴事变”指挥部成立的第二天下午，陈明遇主持召开了第一次军事会议。
参加会议的成员有季世美、黄毓祺、夏维新、冯敦厚、许用、王华、陈瑞之等，城内各坊坊长、县城近郊的顺化、来春、昭闻、太宁四乡乡长，有关特邀人士近百人参加会议。
会议的主题是：加强军事部署，随时歼灭来犯建虏兵。