这也就是《行略》中所说的“其议论无所发泄，一寄之于时文评语，大声疾呼，不顾世所讳忌。”
此时吕留良曾频频出游，写了相当数量的记游诗。
他约友人同游南北湖，即景赋诗，许多诗篇都富有强烈的反清意识。
这三十多首纪游诗，成集时题为《真腊凝寒集》。
另外吕留良还结交了黄虞稷、周在浚等一批新友，写了许多唱和诗，全都收在《零星稿》中。
吕留良与黄宗羲最后由于立身旨趣的歧异，终致绝交。
而吕留良晚年，正值清政府对文人进行软硬并施、加强专制统治的时期。
康熙十七年，清廷开博学鸿词科，企图笼络当时的一批名士。
浙江当事首荐吕留良，吕留良固辞乃始得免，而与他同时代的汤斌则欣然应试，由于缺乏竞争，后得中高官。
康熙十九年，清廷为了进一步拉拢和软化明遗民，征聘天下山林隐逸，嘉兴郡守复荐吕留良。
吕留良在被逼无奈之下，只好削发为僧，取法名耐可，字不昧，号何求老人，去吴兴埭溪之妙山，筑风雨庵，隐居讲学，门人弟子亦甚众。
康熙二十一年秋，吕留良与门人子侄三游南北湖，按出游日程写了一组纪游诗，编成诗集名为《东将诗》。
这时大清江山日益稳固，吕留良时刻惦记的抗清复明基本上已成泡影，这愈发增加了他的愤世嫉俗之感。
吕留良早衰，年四十余须发灰白齿落过半，且幼有咯血疾，遇有怫郁即发。
康熙二十二年，吕留良重游杭州，所写诗篇收入《欬气集》中。
这年八月，吕留良因病与世长辞，终年五十五岁。
临终前数日，吕留良仍勉力补辑《朱子近思录》及《知言集》，作《祈死诗》六篇，子侄弟子劝其休息，答道：“一息尚存，不敢不勉。”
吕留良临终时勉励门人“细心努力为学”，告诫后人一定要恪守“孝友大义”。
忽然吕留良又说：“我此时鼻息间气，有出无入矣。”
门人呼“先生”，留良答曰：“人皆如此！”声音半涩而字义楚楚。
随后吕留良令众人退出，作揖“拱别者三四”。于是从容正容，展伸其足，叉手安寝而逝。