393年)，锦衣卫指挥蒋瓛告发蓝玉谋反，下狱鞫讯后，狱词称同景川侯曹震、鹤寿侯张翼、舳舻侯朱寿、定远侯王弼、东筦伯何荣及吏部尚书詹徽、户部侍郎傅友文等谋反，拟定乘朱元璋藉田时发动叛乱。
正在巩固和加强中央集权的朱元璋深感不安，以谋反罪将其逮捕下狱，并被剥皮实草，抄家，灭三族，并株连蔓引，自公侯伯以至文武官员，被杀者约一万五千人。为警诫群臣，朱元璋手诏布告天下，并条例爰书(中国古代的一种司法文书。)为《逆臣录》。史称“蓝玉案”。
当太子朱标还健在时，蓝玉因为与朱标有亲戚关系，经常友好往来。有一次，蓝玉从蒙古班师回朝，面见朱标时，他告知太子说：“我观察燕王朱棣在他的封地，一举一动与皇帝一模一样。燕王不是一般人，迟早是要造反的，我找过人望他的气，有天子气象，你一定要小心。!”
朱标回答蓝玉：“燕王对待我非常恭敬，绝不会有这种事情。”
蓝玉向朱标解释：“我受到太子您的优待，所以秘密告诉您这件事的厉害，希望我的话不会灵验，更不被我说中。”朱标没再说什么。
蓝玉身为大将军，的确比较跋扈，平时多养义子，乘势暴横。朝中御史按察，他也敢驱逐这些“纪检”人员。而且，俘获北元可汗妃子后，他也敢入帐强奸，使得元主妃子羞愧自杀。
即使没有这些“过错”，以蓝玉的功劳和能力，他也逃不出一个“死”字。
洪武二十六年春，锦衣卫指挥蒋献上告蓝玉“谋反”，蓝玉被逮捕。只要进了大牢，没罪也要有罪，据狱辞上记载：“蓝玉与景川侯曹震、鹤庆侯张翼、舳舻侯朱寿、东莞伯何荣及吏部尚书詹徽、户部侍郎傅友文等密谋为逆，将伺帝外出耕田举事。”这种“口供”，很可能都是屈打成招。
诛文臣杀武将
蓝玉一案，族诛一公、十三侯、二伯，牵连被杀一万五千多人，“元功宿将，相继尽矣。”谋逆之罪一般都是碎剐凌迟处死，念及蓝玉与自己是儿女亲家，老朱心一软，宽大处理：碎剐改成剥皮。这样，刽子手把蓝大将军全须全尾整张人皮剥下来，算是留了全尸，并把人皮送往他女儿蜀王妃处“留念”。明末农民军
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