上报给了陛下，陛下震怒。长安官粮库是朝廷储备粮食的重要场所，粮食亏空三成，不仅会影响赈济灾民的工作，还可能引发百姓恐慌，甚至动摇朝廷的统治根基。陛下当即下令，命锦衣卫与户部联合调查此事，务必查明粮食亏空的原因，揪出幕后黑手。
而萧琰，因曾多次协助锦衣卫破案，且心思缜密、善于观察，被陛下特意指派，协助锦衣卫与户部调查此案。
接到旨意时，萧琰正在翰林院整理史书。他心中有些意外，也有些担忧。官粮库涉及朝廷重要储备，此案必定牵扯甚广，远比之前的张承业案和沈家灭门案复杂。但他没有犹豫，立刻放下手中的工作，前往锦衣卫北镇抚司，与负责此案的锦衣卫指挥使沈炼汇合。
沈炼是锦衣卫中的老将，为人正直，办案经验丰富，之前萧琰曾与他有过一面之缘。见到萧琰，沈炼开门见山：“萧编修，陛下命你协助我们调查粮库亏空案，想必你也清楚此案的重要性。目前我们已经初步调查，发现粮库的账目混乱，负责管理粮库的官员们说辞不一，此案恐怕不简单。”
萧琰点点头：“沈指挥使，我明白此案的严重性。不知目前我们掌握了哪些线索？”
沈炼递给萧琰一本厚厚的账目：“这是粮库近三年的账目，我们初步核对，发现每年都有部分粮食去向不明，而且账目上的记录存在多处涂改痕迹。负责管理粮库的是户部郎中赵德，我们已经传讯过他，可他一口咬定账目无误，粮食减少是因为储存不当、受潮发霉，还拿出了一些所谓的‘损耗记录’。”
萧琰接过账目，仔细翻阅起来。果然，账目中有很多地方的数字被涂改过，而且“损耗记录”上的签名笔迹潦草，看起来很可疑。“沈指挥使，我觉得赵德在撒谎。储存不当导致粮食损耗是正常的，但损耗率不可能这么高，而且账目涂改痕迹明显，‘损耗记录’也很可能是伪造的。我们必须进一步调查赵德，以及粮库的其他官员。”
沈炼认同地说：“我也是这么想的。不过赵德在户部任职多年，根基深厚，背后可能有人撑腰，我们调查他，恐怕会遇到阻力。而且粮库的其他官员，要么与赵德串通一气，要么害怕被报复，不敢说实话，想要从他们口中套出
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